Na každé straně prostaty (v mužském reprodukčním systému) je ejakulační kanál.
Každý ejakulační kanál je dlouhý asi dva centimetry a je vytvořen, když se kanál semenného váčku spojí s vas deferens. V tomto okamžiku tyto kanály procházejí prostatou a na jejím vzdáleném konci odtékají do uretry colliculus seminalis.
Během ejakulace protéká spermatem každý ejakulační kanál a cestuje penisem a opouští tělo.
Jeden ejakulační kanál nebo obojí se může stát vrozeným (od narození) nebo získanou patologickou komplikací známou jako obstrukce ejakulačního kanálu. Jsou-li ucpané oba kanály, u pacientů se pravděpodobně projeví příznaky, jako je neplodnost a azoospermie (nízký počet spermií) nebo aspermie (absence spermií). Transuretrální resekce je chirurgický zákrok, který lze použít k otevření potrubí; jeho cílem je znovu umožnit pravidelný tok ejakulace.
Benigní prostatická hyperplázie, která se týká abnormálního zvětšení velikosti prostaty, je dalším stavem, který může ovlivnit ejakulační kanály. Přestože je tento stav odstranitelný chirurgickým zákrokem, mohlo by dojít k poškození ejakulačního kanálu, což by způsobilo retrográdní ejakulaci.